В системе федеральных налогов взимаются платежи, связанные с использованием природных ресурсов:
-  налог на добычу полезных ископаемых;
-  водный налог;
- лесной налог;
- экологический налог.
Установление данных платежей преследует следующие цели:
- регулирование природопользования;
-    стимулирование рационального использования природных ресурсов;
- охрана окружающей среды;
-  формирование денежных средств для охраны и воспроизводства природных ресурсов.
То есть эти платежи направлены на выполнение фискальной и экономической функций.
Они должны повышать эффективность использования и охраны земель, лесов,   водных объектов, недр.
Федеральные платежи, связанные с использованием приодных ресурсов также оказывают эффективное воздействие на добычу и рациональное использование минерально-сырьевых ресурсов. В настоящее время развитие и эффективное использование природно-сырьевой базы РФ становятся одним из главных факторов роста ее экономики.
По мнению отдельных специалистов, налогообложение природных ресурсов является одной из сложнейших проблем при реформировании налоговой системы Российской Федерации.
В условиях спада производства и недостаточности бюджетных средств в такой богатой ресурсами стране, как Россия, именно платежи за природопользование могут взять
на себя фискальную функцию налоговой системы.
При дальнейшем совершенствовании налоговой системы следует переносить основную тяжесть налогообложения с доходов, получаемых от производственной, трудовой, инновационной деятельности. В перспективе фискальная роль платежей за природные ресурсы должна возрасти.
Одним из источников финансирования расходов государства на охрану окружающей среды являются плата за нормативные и сверхнормативные выбросы, а также другие виды загрязнений. Однако в налоговой системе РФ плата за загрязнение окружающей природной среды не играет существенной фискальной роли.
Субъектами налогообложения являются российские организации, а также иностранные юридические и физические лица, осуществляющие любые связанные с природопользованием виды деятельности на территории РФ.
Сумма платежей складывается из платы за виды загрязнения: в предельно допустимых размерах; в пределах установленных лимитов; сверх установленных лимитов.
Минприроды России были разработаны и утверждены базовые нормативы платы за выбросы, сбросы загрязняющих веществ, а также коэффициенты, учитывающие экологические факторы.
Налоговой базой являются объемы вредного воздействия за выброс или сброс 1 т загрязняющих веществ. Указанные нормы ежегодно индексируются в связи с изменением уровня цен на природное строительство и по другим направлениям природоохранной деятельности.
Плата за загрязнение окружающей природной среды вносится в соответствующие бюджеты либо ежеквартально плановыми платежами с последующим годовым перерасчетом по фактическим данным о произведенных загрязнениях.
Плата за предельно допустимые и лимитные загрязнения относится на затраты плательщика. За сверхлимитное загрязнение окружающей среды плата увеличивается в 5 раз. Однако поскольку абсолютные суммы таких платежей весьма невелики, то и роль их незначительна.